برخی مواد گیاهی موجود در داروی بیوهربال با هدف ضدمیکروبی و ضدعفونی در فرمول دارو اضافه شده‌اند. از جمله این گیاهان آویشن است که حاوی مواد موثره‌ای مانند تایمول، کارواکرولمی باشد. با اضافه کردن داروی بیوهربال در آب محل پرورش ماهیان، مواد گیاهی آن در درجه اول آب محل پرورش را ضدعفونی کرده و همچنین میکروب‌های ساپروفیت (فرصت‌طلب) موجود در سطح بدن ماهی و سطح آبشش‌ها را نیز کاهش داده و ترکیب جمعیتی این میکروب‌های سطحی را به سمت میکروب‌های مفید تغییر می‌دهند، همچنین بعد از مصرف توسط ماهی نیز، درون بدن ماهی به سمت میکروب‌های عفونی جذب شده و موجب نابودی آنها می‌شوند.

بهبود ترکیب جمعیتی میکروبی روده و بهبود اشتها و تغذیه  به عوامل متعددی مربوط است. از جمله این عوامل ترکیب جمعیتی میکروب‌های روده‌ است. برخی مواد موجود در بیوهربال آبزیان مانند آویشن و نعناع قادرند از طریق مکانیسم‌هایی هم مستقیما اشتها را افزایش دهند و هم ترکیب جمعیتی میکروبی روده‌ها را طوری تغییر دهند که جمعیت میکروب‌های عفونی به صفر برسد یا بسیار کم شود و جمعیت میکروب‌های مفید که در هضم و تولید برخی مواد مغذی برای ماهی نقش دارند، بیشتر شود.

برخی مواد موثره گیاهی بیوهربال مانند  کارواکرول و منتول اثرات شناخته شده عصبی دارند. این مواد موثره قادر به تحریک گیرنده‌های خاصی در نورون‌ها (سلول‌های عصبی) هستند. تحریک این نورون‌ها علاوه بر اینکه موجب آرامش و کاهش استرس در ماهی می‌شود، موجب افزایش اشتها از طریق تحریک مسیر پاراسمپاتیک نیز می‌شود بدین صورت که از طریق اعصاب پاراسمپاتیک پیام تحریکی به بطن میانی هیپوتالاموس (VMH) منتقل شده و با تحریک آن موجب افزایش اشتها و بهبود میزان اخذ غذا می‌شوند.

همچنین تحریک گیرنده های عصبی در مخاط دستگاه گوارش توسط محرک‌های گیاهی مذکور، باعث ترشح نوعی نوروپپتید ویژه به نـام Neuropeptide.y می‌شود کـه بصـورت سیگنال از طریق جریان خون، به بطن میانی هیپوتالاموس رسیده و با تحریک آن موجب افزایش میزان اشتها و افزایش غذای خورده شده می‌شود.

از طرف دیگر، فیتوکمیکال‌های موجود در بیوهربال مانند کارواکرول، تایمول و… بعنوان مواد ضدباکتری، ضدقارچ و ضد ویروس کاملا طبیعی و بسیار قوی شناخته شده‌اند و سبب سرکوب انواع میکروب‌ها و عوامل آنتریت روده‌ای در ماهی می‌شوند در حالیکه روی باکتری‌های مفید و سلول‌های عادی بدن اثری ندارند. در نتیجه با تقلیل التهاب موضعی و ایجاد شرایط مناسب برای رشد باکتری‌های مفید، سبب تکثیر این گروه از باکتری‌ها در روده‌ها می‌شوند و به بیان دیگر نقش نوعی پربیوتیک را ایفا می‌کنند.

مجموعه شرایط ایجاد شده موجب کاهش مصرف مواد غذایی مفید توسط میکروب‌های عفونی شده از طرف دیگر مواد مغذی مفیدی نیز توسط میکروب‌های مفید تولید می‌شود. در نتیجه مواد سمی کمتری در روده تولید می‌شود، مواد مغذی بیشتری به ماهی می‌رسد و با کاهش التهاب مخاط روده، موجب بهبود جذب مواد غذایی و بهبود راندمان تغذیه‌ای ماهی می‌شوند. همچنین از تخریب پرزهای روده‌ای پیشگیری شده و شرایط افزایش طول پرزها و عمق کریپت‌های روده‌ای فراهم و میزان ترشح آنزیم و درصد جذب مواد غذایی بالا می رود.